MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter hominis ATCC BAA-381 plasmid pCH4

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009713	ATT	2	6	71	76	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154147865
2	NC_009713	TAT	2	6	81	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154147865
3	NC_009713	A	6	6	104	109	100 %	0 %	0 %	0 %	154147865
4	NC_009713	CTG	2	6	186	191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154147865
5	NC_009713	ATA	2	6	338	343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154147864
6	NC_009713	ATTT	2	8	389	396	25 %	75 %	0 %	0 %	154147864
7	NC_009713	T	6	6	394	399	0 %	100 %	0 %	0 %	154147864
8	NC_009713	AAATT	2	10	442	451	60 %	40 %	0 %	0 %	154147864
9	NC_009713	ATA	2	6	479	484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154147864
10	NC_009713	TAA	2	6	512	517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154147864
11	NC_009713	ATG	2	6	518	523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154147864
12	NC_009713	TGA	3	9	612	620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154147864
13	NC_009713	CAG	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154147864
14	NC_009713	TTTA	2	8	657	664	25 %	75 %	0 %	0 %	154147864
15	NC_009713	AAT	2	6	670	675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154147864
16	NC_009713	AC	3	6	737	742	50 %	0 %	0 %	50 %	154147864
17	NC_009713	AAC	2	6	919	924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154147864
18	NC_009713	A	6	6	934	939	100 %	0 %	0 %	0 %	154147864
19	NC_009713	A	7	7	949	955	100 %	0 %	0 %	0 %	154147864
20	NC_009713	CAGG	2	8	965	972	25 %	0 %	50 %	25 %	154147864
21	NC_009713	TTTTA	2	10	997	1006	20 %	80 %	0 %	0 %	154147864
22	NC_009713	CGA	2	6	1017	1022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154147864
23	NC_009713	A	6	6	1078	1083	100 %	0 %	0 %	0 %	154147864
24	NC_009713	TGA	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154147864
25	NC_009713	ATTTA	2	10	1344	1353	40 %	60 %	0 %	0 %	154147864
26	NC_009713	ACC	3	9	1542	1550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154147862
27	NC_009713	A	6	6	1622	1627	100 %	0 %	0 %	0 %	154147862
28	NC_009713	GAT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154147861
29	NC_009713	A	6	6	1833	1838	100 %	0 %	0 %	0 %	154147861
30	NC_009713	TAA	2	6	1891	1896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154147861
31	NC_009713	A	6	6	1895	1900	100 %	0 %	0 %	0 %	154147861
32	NC_009713	AATA	2	8	1918	1925	75 %	25 %	0 %	0 %	154147861
33	NC_009713	TATT	2	8	1931	1938	25 %	75 %	0 %	0 %	154147861
34	NC_009713	ATAGG	2	10	1947	1956	40 %	20 %	40 %	0 %	154147861
35	NC_009713	AAT	2	6	1958	1963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154147861
36	NC_009713	AAT	2	6	2006	2011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154147861
37	NC_009713	AAAAG	2	10	2059	2068	80 %	0 %	20 %	0 %	154147861
38	NC_009713	T	6	6	2083	2088	0 %	100 %	0 %	0 %	154147863
39	NC_009713	A	6	6	2095	2100	100 %	0 %	0 %	0 %	154147863
40	NC_009713	AG	3	6	2138	2143	50 %	0 %	50 %	0 %	154147863
41	NC_009713	CGA	2	6	2175	2180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154147863
42	NC_009713	CGA	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154147863
43	NC_009713	TGA	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154147863
44	NC_009713	ATA	2	6	2339	2344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154147863
45	NC_009713	ACAA	2	8	2412	2419	75 %	0 %	0 %	25 %	154147863
46	NC_009713	A	6	6	2418	2423	100 %	0 %	0 %	0 %	154147863
47	NC_009713	AAG	2	6	2606	2611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154147863
48	NC_009713	A	6	6	2613	2618	100 %	0 %	0 %	0 %	154147863
49	NC_009713	AGCCG	2	10	2632	2641	20 %	0 %	40 %	40 %	154147863
50	NC_009713	ATT	2	6	2644	2649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154147863
51	NC_009713	TAC	2	6	2654	2659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154147863
52	NC_009713	ACA	2	6	2720	2725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154147863
53	NC_009713	AG	4	8	2811	2818	50 %	0 %	50 %	0 %	154147863
54	NC_009713	ATA	2	6	2840	2845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154147863
55	NC_009713	CGG	2	6	2846	2851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154147863
56	NC_009713	TGA	2	6	2976	2981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154147863
57	NC_009713	CGAA	2	8	2990	2997	50 %	0 %	25 %	25 %	154147863
58	NC_009713	T	7	7	3039	3045	0 %	100 %	0 %	0 %	154147863
59	NC_009713	TGA	2	6	3102	3107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154147863
60	NC_009713	AAG	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154147863
61	NC_009713	GA	4	8	3211	3218	50 %	0 %	50 %	0 %	154147863
62	NC_009713	CAA	2	6	3250	3255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154147863
63	NC_009713	ATC	2	6	3262	3267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154147863
64	NC_009713	AG	3	6	3283	3288	50 %	0 %	50 %	0 %	154147863
65	NC_009713	GA	3	6	3290	3295	50 %	0 %	50 %	0 %	154147863
66	NC_009713	AG	3	6	3325	3330	50 %	0 %	50 %	0 %	154147863
67	NC_009713	AG	3	6	3343	3348	50 %	0 %	50 %	0 %	154147863
68	NC_009713	AGC	3	9	3425	3433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154147863
69	NC_009713	ACGA	2	8	3434	3441	50 %	0 %	25 %	25 %	154147863
70	NC_009713	GAC	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154147863
71	NC_009713	GA	3	6	3554	3559	50 %	0 %	50 %	0 %	154147863
72	NC_009713	AG	3	6	3634	3639	50 %	0 %	50 %	0 %	154147863

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.